A - Papers appearing in refereed journals
Zdouc, M. M., Blin, K., Louwen, N. L., Navarro, J., Loureiro, C., Bader, C. D., Bailey, C. B., Barra, L., Booth, T. J., Bozhuyuk, K. A., Cediel-Becerra, J. D., Charlop-Powers, Z., Chevrette, M. G., Chooi, Y. H., D’Agostino, P. M., Rond, T. D., Pup, E. D., Duncan, K. R., Gu, W., Hanif, N., Helfrich, E. J., Jenner, M., Katsuyama, Y., Korenskaia, A., Krug, D., Libis, V., Lund, G., Mantri, S., Morgan, K. D., Owen, C., Phan, C., Philmus, B., Reitz, Z. L., Robinson, S. L., Singh, K. S., Teufel, R., Tong, Y., Tugizimana, F., Ulanova, D., Winter, J. M., Aguilar, C., Akiyama, D. Y., Al-Salihi, S. A., Alanjary, M., Alberti, F., Aleti, G., Alharthi, S. A., Rojo, M. Y. A., Arishi, A. A., Augustijn, H. E., Avalon, N. E., Avelar-Rivas, J. A., Axt, K. K., Barbieri, H. B., Barbosa, J. C. J., Segato, L. G. B., Barrett, S. E., Baunach, M., Beemelmanns, C., Beqaj, D., Berger, T., Bernaldo-Aguero, J., Bettenbuhl, S. M., Bielinski, V. A., Biermann1, F., Borges, R. M., Borriss, R., Breitenbach, M., Bretscher, K. M., Brigham, M. W., Buedenbender, L., Bulcock, B. W., Cano-Prieto, C., Capela, J., Carrion, V. J., Carter, R. S., Castelo-Branco, R., Castro-Falcon, G., Chagas, F. O., Charria-Giron, E., Chaudhri, A. A., Chaudhry, V., Choi, H., Choi, Y., Choupannejad, R., Chromy, J., Donahey, M. S. C., Collemare, J., Connolly, J. A., Creamer, K. E., Crusemann, M., Cruz, A. A., Cumsille, A., Dallery, J., Damas-Ramos, L. C., Damiani, T., Kruijff, M. D., Martin, B. D., Sala, G. D., Dillen, J., Doering, D. T., Dommaraju, S. R., Durusu, S., Egbert, S., Ellerhorst, M., Faussurier, B., Fetter, A., Feuermann, M., Fewer, D. P., Foldi, J., Frediansyah, A., Garza, E. A., Gavriilidou, A., Gentile, A., Gerke, J., Gerstmans, H., Gomez-Escribano, J. P., Gonzalez-Salazar, L. A., Grayson, N. E., Greco, C., Gomez, J. E. G., Guerra, S., Flores, S. G., Gurevich, A., Gutierrez-Garcia, K., Hart, L., Haslinger, K., He, B., Hebra, T., Hemmann, J. L., Hindra, H., Hoing, L., Holland, D. C., Holme, J. E., Horch, T., Hrab, P., Hu, J., Huynh, T., Hwang, J., Lacovelli, R., Lftime, D., Lorio, M., Jayachandran, S., Jeong, E., Jing, J., Jung, J. J., Kakumu, Y., Kalkreuter, E., Kang, K. B., Kang, S., Kim, W., Kim, G. J., Kim, H., Kim, H. U., Klapper, M., Koetsier, R. A., Kollten, C., Kovacs, A. T., Kriukova, Y., Kubach, N., Kunjapur, A. M., Kushnareva, A. K., Kust, A., Lamber, J., Larralde, M., Larsen, N. J., Launay, A. P., Le, N., Lebeer, S., Lee, B. T., Lee, K., Lev, K. L., Li, S., Li, Y., Licona-Cassani, C., Lien, A., Liu, J., Lopez, J. A. V., Machushynets, N. V., Macias, M. I., Mahmud, T., Maleckis, M., Martinez-Martinez, A. M., Mast, Y., Maximo, M. F., McBride, C. M., McLellan, R. M., Bhatt, K. M., Melkonian, C., Merrild, A., Metsä-Ketela, M., Mitchell, D. A., Müller, A. V., Nguyen, G., Nguyen, H. T., Niedermeyer, T. H. J., O’Hare, J. H., Ossowicki, A., Ostash, B. O., Otani, H., Padva, L., Paliya, S., Pan, X., Panghal, M., Parade, D. S., Park, J., Parra, J., Rubio, M. P., Pham, H. T., Pidot, S. J., Piel, J., Pourmohsenin, B., Rakhmanov, M., Ramesh, S., Rasmussen, M. H., Rego, A., Reher, R., Rice, A. J., Rigolet, A., Romero-Otero, A., Rosas-Becerra, L. R., Rosiles, P. Y., Rutz, A., Ryu, B., Sahadeo, L., Saldanha, M., Salvi, L., Sánchez-Carvajal, E., Santos-Medellin, C., Sbaraini, N., Schoellhorn, S. M., Schumm, C., Sehnal, L., Selem, N., Shah, A. D., Shishido, T. K., Sieber, S., Silviani, V., Singh, G., Singh, H., Sokolova, N., Sonnenschein, E. C., Sosio, M., Sowa, S. T., Steffen, K., Stegmann, E., Streiff, A. B., Strüder, A., Surup, F., Svenningsen, T., Sweeney, D., Szenei, J., Tagirdzhanov, A., Tan, B., Tarnowski, M. J., Terlouw1, B. R., Rey, T., Thome, N. U., Ortega, L. R. T., Torring, T., Trindade, M., Truman, A. W., Tvilum, M., Udwary, D. W., Ulbricht, C., Vader, L., Wezel, G. P. V., Walmsley, M., Warnasinghe, R., Weddeling, H. G., Weir, A. N., Williams, K., Williams, S. E., Witte, T. E., Rocca, S. M. W., Yamada, K., Yang, D., Yang, D., Yu, J., Zhou, Z., Ziemert, N., Zimmer, L., Zimmermann, A., Zimmermann, C., Hooft, J. J. V. D., Linington, R. G., Weber, T. and Medema, M. H. 2025. MIBiG 4.0: advancing biosynthetic gene cluster curation through global collaboration. Nucleic Acids Research. 53 (D1), p. D678–D690. https://doi.org/10.1093/nar/gkae1115
Authors | Zdouc, M. M., Blin, K., Louwen, N. L., Navarro, J., Loureiro, C., Bader, C. D., Bailey, C. B., Barra, L., Booth, T. J., Bozhuyuk, K. A., Cediel-Becerra, J. D., Charlop-Powers, Z., Chevrette, M. G., Chooi, Y. H., D’Agostino, P. M., Rond, T. D., Pup, E. D., Duncan, K. R., Gu, W., Hanif, N., Helfrich, E. J., Jenner, M., Katsuyama, Y., Korenskaia, A., Krug, D., Libis, V., Lund, G., Mantri, S., Morgan, K. D., Owen, C., Phan, C., Philmus, B., Reitz, Z. L., Robinson, S. L., Singh, K. S., Teufel, R., Tong, Y., Tugizimana, F., Ulanova, D., Winter, J. M., Aguilar, C., Akiyama, D. Y., Al-Salihi, S. A., Alanjary, M., Alberti, F., Aleti, G., Alharthi, S. A., Rojo, M. Y. A., Arishi, A. A., Augustijn, H. E., Avalon, N. E., Avelar-Rivas, J. A., Axt, K. K., Barbieri, H. B., Barbosa, J. C. J., Segato, L. G. B., Barrett, S. E., Baunach, M., Beemelmanns, C., Beqaj, D., Berger, T., Bernaldo-Aguero, J., Bettenbuhl, S. M., Bielinski, V. A., Biermann1, F., Borges, R. M., Borriss, R., Breitenbach, M., Bretscher, K. M., Brigham, M. W., Buedenbender, L., Bulcock, B. W., Cano-Prieto, C., Capela, J., Carrion, V. J., Carter, R. S., Castelo-Branco, R., Castro-Falcon, G., Chagas, F. O., Charria-Giron, E., Chaudhri, A. A., Chaudhry, V., Choi, H., Choi, Y., Choupannejad, R., Chromy, J., Donahey, M. S. C., Collemare, J., Connolly, J. A., Creamer, K. E., Crusemann, M., Cruz, A. A., Cumsille, A., Dallery, J., Damas-Ramos, L. C., Damiani, T., Kruijff, M. D., Martin, B. D., Sala, G. D., Dillen, J., Doering, D. T., Dommaraju, S. R., Durusu, S., Egbert, S., Ellerhorst, M., Faussurier, B., Fetter, A., Feuermann, M., Fewer, D. P., Foldi, J., Frediansyah, A., Garza, E. A., Gavriilidou, A., Gentile, A., Gerke, J., Gerstmans, H., Gomez-Escribano, J. P., Gonzalez-Salazar, L. A., Grayson, N. E., Greco, C., Gomez, J. E. G., Guerra, S., Flores, S. G., Gurevich, A., Gutierrez-Garcia, K., Hart, L., Haslinger, K., He, B., Hebra, T., Hemmann, J. L., Hindra, H., Hoing, L., Holland, D. C., Holme, J. E., Horch, T., Hrab, P., Hu, J., Huynh, T., Hwang, J., Lacovelli, R., Lftime, D., Lorio, M., Jayachandran, S., Jeong, E., Jing, J., Jung, J. J., Kakumu, Y., Kalkreuter, E., Kang, K. B., Kang, S., Kim, W., Kim, G. J., Kim, H., Kim, H. U., Klapper, M., Koetsier, R. A., Kollten, C., Kovacs, A. T., Kriukova, Y., Kubach, N., Kunjapur, A. M., Kushnareva, A. K., Kust, A., Lamber, J., Larralde, M., Larsen, N. J., Launay, A. P., Le, N., Lebeer, S., Lee, B. T., Lee, K., Lev, K. L., Li, S., Li, Y., Licona-Cassani, C., Lien, A., Liu, J., Lopez, J. A. V., Machushynets, N. V., Macias, M. I., Mahmud, T., Maleckis, M., Martinez-Martinez, A. M., Mast, Y., Maximo, M. F., McBride, C. M., McLellan, R. M., Bhatt, K. M., Melkonian, C., Merrild, A., Metsä-Ketela, M., Mitchell, D. A., Müller, A. V., Nguyen, G., Nguyen, H. T., Niedermeyer, T. H. J., O’Hare, J. H., Ossowicki, A., Ostash, B. O., Otani, H., Padva, L., Paliya, S., Pan, X., Panghal, M., Parade, D. S., Park, J., Parra, J., Rubio, M. P., Pham, H. T., Pidot, S. J., Piel, J., Pourmohsenin, B., Rakhmanov, M., Ramesh, S., Rasmussen, M. H., Rego, A., Reher, R., Rice, A. J., Rigolet, A., Romero-Otero, A., Rosas-Becerra, L. R., Rosiles, P. Y., Rutz, A., Ryu, B., Sahadeo, L., Saldanha, M., Salvi, L., Sánchez-Carvajal, E., Santos-Medellin, C., Sbaraini, N., Schoellhorn, S. M., Schumm, C., Sehnal, L., Selem, N., Shah, A. D., Shishido, T. K., Sieber, S., Silviani, V., Singh, G., Singh, H., Sokolova, N., Sonnenschein, E. C., Sosio, M., Sowa, S. T., Steffen, K., Stegmann, E., Streiff, A. B., Strüder, A., Surup, F., Svenningsen, T., Sweeney, D., Szenei, J., Tagirdzhanov, A., Tan, B., Tarnowski, M. J., Terlouw1, B. R., Rey, T., Thome, N. U., Ortega, L. R. T., Torring, T., Trindade, M., Truman, A. W., Tvilum, M., Udwary, D. W., Ulbricht, C., Vader, L., Wezel, G. P. V., Walmsley, M., Warnasinghe, R., Weddeling, H. G., Weir, A. N., Williams, K., Williams, S. E., Witte, T. E., Rocca, S. M. W., Yamada, K., Yang, D., Yang, D., Yu, J., Zhou, Z., Ziemert, N., Zimmer, L., Zimmermann, A., Zimmermann, C., Hooft, J. J. V. D., Linington, R. G., Weber, T. and Medema, M. H. |
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Abstract | Specialized or secondary metabolites are small molecules of biological origin, often showing potent biological activities with applications in agriculture, engineering and medicine. Usually, the biosynthesis of these natural products is governed by sets of co-regulated and physically clustered genes known as biosynthetic gene clusters (BGCs). To share information about BGCs in a standardized and machine-readable way, the Minimum Information about a Biosynthetic Gene cluster (MIBiG) data standard and repository was initiated in 2015. Since its conception, MIBiG has been regularly updated to expand data coverage and remain up to date with innovations in natural product research. Here, we describe |
Year of Publication | 2025 |
Journal | Nucleic Acids Research |
Journal citation | 53 (D1), p. D678–D690 |
Digital Object Identifier (DOI) | https://doi.org/10.1093/nar/gkae1115 |
Open access | Published as ‘gold’ (paid) open access |
Funder | Biotechnology and Biological Sciences Research Council |
Funder project or code | Growing Health [ISP] |
Growing Health (WP2) - bio-inspired solutions for healthier agroecosystems: Understanding soil environments | |
Publisher's version | |
Output status | Published |
Publication dates | |
Online | 06 Jan 2025 |
Publication process dates | |
Accepted | 10 Dec 2024 |
Publisher | Oxford University Press (OUP) |
ISSN | 0305-1048 |
Permalink - https://repository.rothamsted.ac.uk/item/9934z/mibig-4-0-advancing-biosynthetic-gene-cluster-curation-through-global-collaboration